К достоинствам мультизональных сплит-систем безусловно относятся высокая надежность, длительный срок службы, малая площадь занимаемая оборудованием, простота эксплуатации. Основные недостатки - относительно высокая стоимость оборудования и сложность ремонта и изменения конфигурации систем. В случае разгерметизации фреонового контура все блоки аварийного контура оказываются неработоспособными. Перенос любого внутреннего блока, его замена также невозможна без остановки наружного блока и дозаправки системы фреоном.
Недостатки. В случае с простыми сплит-системами, указанные системы лишь производят местное охлаждение, задачу организации притока свежего воздуха требуется решать отдельно.